作為絮凝劑，陽離子聚丙烯酰胺主要應用于工業上的固液分離過程，包括沉降、澄清、濃縮及污泥脫水等工藝，主要應用行業有：城市污水處理、造紙工業、食品加工業、石化工業、冶金工業、選礦工業、染色工業和制糖工業及各種工業的廢水處理。

1.陽離子聚丙烯酰胺用在城市污水及肉類、禽類、食品加工廢水處理過程中的污泥沉淀及污泥脫水上，通過其所含的正電荷基團對污泥中的負電荷有機膠體電性中和作用及高分子優異的架橋凝聚功能，促使膠體顆粒聚集成大塊絮狀物，從其懸浮液中分離出來。效果明顯，投加量少。
2、陽離子聚丙烯酰胺在造紙工業中可用作紙張干強劑、助留劑、助濾劑，能極大的提高成紙質量，節約成本，提高造紙廠的生產能力?？芍苯优c無機鹽離子、纖維以及其它有機高分子發生靜電橋梁作用以達到增強紙張的物理強度, 減少纖維或填料的流失,加快濾水,起增強、助留、助濾作用,還可以用于白水的處理,同時，陽離子聚丙烯酰胺在脫墨過程中能起明顯的絮凝效果。
3、陽離子聚丙烯酰胺對纖維泥漿(石棉-水泥制品)中可使成型的石棉-水泥制品排水性得到改善,使石棉板坯料的強度提高;在絕緣板中,可提高添加劑和纖維的結合能力。
4、陽離子聚丙烯酰胺在采礦、選煤行業中可作礦山廢水、洗煤廢水的澄清劑。
5、陽離子聚丙烯酰胺可用于染色廢水、皮革廢水、含油廢水的處理,使之除濁、脫色,以達到排放標準。
6、陽離子聚丙烯酰胺在磷酸提純中,有助于濕法磷酸工藝中石膏的分離。
7、陽離子聚丙烯酰胺用于以江河水源的自來水廠的水處理絮凝劑。